孩子服用抗生素比大人复杂得多。一般来说，抗生素治疗的疗程因疾病种类、病情的严重程度以及对现有的治疗反应等不同而有所差异，所以药物剂量必须由医生来决定。许多人简单地以为：儿童用药的剂量就是成人剂量减半，这种观点是错误的。医生在考虑患儿病情、药物在体内的代谢特点等之外，还要考虑药物对患有肝、肾病儿童的影响，以及药物可能带来的毒副作用。
孩子服用抗生素，尤其要警惕不良反应。抗生素引发的不良反应主要包括过敏反应、毒性反应以及二重感染。过敏反应的形式多种多样，轻者可出现皮疹、药物热、血管神经性水肿，严重的还会出现哮喘，甚至过敏性休克。毒性反应一般可见由氯霉素引起的再生障碍性贫血，庆大霉素等引起的耳聋等。由于抗生素应用后会杀灭或抑制敏感细菌，未被抑制的菌种会大量繁殖，发生菌群紊乱，因而在用药过程中还可能出现霉菌、耐药菌等引起的二重感染。这种感染轻的会出现口腔、胃肠道感染，重者会发展成为败血症，甚至危及生命。
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