1.脂肪肝会发展为肝硬化
长期大量的肝细胞内脂肪堆积，使其血液供应、氧气供应及自身的代谢受到影响，造成肝细胞大量肿胀、炎症浸润及变性坏死。一旦肝脏有纤维增生及假小叶形成，就成为肝硬化。
2.可致肝癌
脂肪肝疾患本身与原发性肝癌的发生无直接关系，脂肪肝不是肝癌的危险因素。但是，脂肪肝的某些病因，如饮酒、营养不良、药物及毒物质损害等，既是脂肪肝的发病因素，也是肝癌的发病因素，因此，脂肪肝对肝癌的发生有一个助动因素，可增加癌变的机率。
3.诱发或加重高血压、冠心病
动脉硬化与高血压、冠心病的关系十分密切，研究表明，酒精性脂肪肝患者合并高血压、冠心病，容易导致心肌梗塞而猝死。
4.诱发或加重糖尿病
据调查糖尿病患者中合并脂肪肝约50%，脂肪肝患者中合并糖尿病的约30～40%，脂肪肝患者的血糖水平明显高于正常人，肥胖性脂肪肝患者若血糖浓度超过正常水平，虽未达到糖尿病的诊断标准，一般认为是糖尿病前期。脂肪肝与糖尿病是一对难兄难弟，两者兼有的话将给治疗带来更大的困难，顾此失彼，加速病情发展。
5.损伤消化系统
胃、肠、肝、胆都是消化系统的重要器官，机体摄取三大营养素（蛋白、脂肪、糖）都要经过肝脏的代谢才能被机体所利用，脂肪肝患者肝脏功能受损，时间一长就会累及脾、胆、胃、肠
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