西医常规治疗：
由于急性肾盂肾炎超过6个月未治愈即转变为慢性，故应早期彻底治疗；由于慢性肾盂肾炎反复发作，致使肾脏中炎症和修复过程交替进行，结缔组织增生和瘢痕形成，使得局部血运差，抗生素不易进入病灶；局部引流不畅，致病菌难以清除，因此炎症难控制，受损的肾组织不易修复。而受损肾组织在恢复之前，也是引起反复感染的一个重要因素。因而慢性肾盂肾炎治疗的重点为尽快消灭致病菌，促使受损肾组织尽快恢复。同时积极寻找易感因素，并消除或避免，如尿路结石、畸形、前列腺增生、盆腔及外阴部的感染灶等；是抗菌治疗有效的前提。抗菌治疗的原则如下：
1、 应针对致病菌及药敏选择有效药物，应审慎筛选药物，观察疗效。定期作尿细菌培养和菌落计数，并针对药敏试验的结果来选择最敏感的抗生素。对于有尿路梗阻及感染原因（如尿路结石、膀胱颈梗阻、盆腔感染等）者，应及时排除并针对病因治疗。
2、 由于治病菌较为顽固，一般抗菌药物多采用联合用药方法，如SMZ＋TMP，呋喃旦啶加庆大霉素，亦可选用氟哌酸、羧苄青霉素、妥布霉素、先锋必等，疗程一般为两周，间隔5～7天后再进行下一疗程。直至尿常规及培养阴转时为止。有时总计疗程需时2～4个月。疗程一定要足够，如不能足疗程的治疗，即使原治疗有效果但不能彻底清除病原菌，同时也培养了耐药菌，使致病菌得残存，一旦条件适合，即又复发，病情迁延。因此慢性肾盂肾炎急性发作时，按急性肾盂肾炎的治疗原则用药，总疗程不少于四周。当所有临床症状被控制后，可停药观察，每月复查尿常规和尿培养，一般为6个月左右。在抗菌疗法无效时，可用抑菌疗法。具体方法2片（或呋喃旦啶0。1g；萘啶酸0。5g；氟哌酸0。2g ）连续3～6个月，约60％患者尿培养可阴转。此法费时长，应注意药物的毒副作用。
微化中药渗透疗法
根据引起肾脏损害的免疫损伤和导致肾脏血液灌注障碍的原发与继发的各类肾脏病均有独特效果，其对肾盂肾炎治疗的作用与功能分述如下：
1、对肾脏免疫损伤的作用原理
双相调节免疫功能
利用微化化后具有极强的免疫活性之性能；结合其特异的靶向定位；以及对病灶的亲和力这一特性，中药活性物质进入病人体内，定向的激活免疫功能低下病人的免疫系统，促使抗体生成；同时对免疫过剩的病人选择性的抑制其亢进应激状态；促使处于紊乱状态趋于平衡；减少免疫介导的炎性介质对肾脏继续损伤。减少系膜细胞增生，减慢肾小球继续硬化速度，恢复受损功能，改善机体状态，增加抗病能力。
选择性靶向定位于肾脏病变组织，彻底清除免疫复合物的功能：
免疫活性极强的微化化后的中药活性物质，进入病人体内，快速定位于免疫复合物沉积的病变部位，起到以下作用：（1）首先与沉积的免疫复合物与病变组织融合；（2）有效融合后，重新聚集为新的分子，改变了细胞分子的价键结构并迅速释放出攻击性药物成份。（3）免疫复合物以及肾脏病变组织在有效药物成份攻击下迅速分化、崩解、破碎，其散落的碎片由以下途径清除。（1） 激活吞噬细胞，对攻击破碎的较大碎片吞噬。（2） 其余中小分子被体内排泄和代谢掉。
这是微化化后中药活性物质清除免疫复合物以及化瘀的主要途径，为修复受损肾脏组织奠定了基础。
2、 针对导致肾脏血流灌注障碍的作用原理
活血通络、改善微循环障碍：
（1）微化化后的中药活性物质选择性靶向定位体内的植物神经系统以及促进肾脏组织内的前列腺素分泌，扩张肾脏以及全身的小动脉，改善全身及受损肾脏微循环障碍。
（2）改善胃肠道粘膜微循环，减少粘膜水肿，促使消化液分泌，增进病人食欲。
（3）促进周围血管扩张，改善体表微循环，促进汗孔开放，促进毒素由汗液排出。
扩张肾动脉增加受损肾脏有效血液灌注，增加对肾脏供氧，改善肾脏微循环，降低肾小球内压，促进肾小球修复、受损病变组织结构改变、功能恢复。
微化中药活性物质治疗肾脏病、尿毒症的三个治疗过程及其病理、病理生理、临床变化。
第一过程，对肾脏病变组织供氧、改善微循环，降低肾小球内压过程（降低肾小球内压阶段）
进入肾脏内的微化化后的中药活性物质具有以下作用：① 首先选择性的靶向定位于受损肾脏各级动脉血管，并与其紧密融合；② 促使肾动脉扩张，增加肾脏有效血液灌注；增加对受损肾小球的供氧，改善微循环，增加新陈代谢、降低肾小球内压，减轻肾小球高滤过状态。③ 延缓病情进展。
1、该步骤如果完成后其肾脏血流动力学改变，就能缓解肾小球的高灌注；就会缓解肾小球内高压；就会缓解高滤过状态；延缓和停止肾小球硬化进程。
2、该阶段如果完成以后其临床表现：① 尿蛋白、潜血开始减少；② 尿肌酐开始增加；③ 血肌酐开始下降；④ 肾性高血压，逐步得到缓解；⑤ 全身中毒症状缓解，如乏力减轻，呕吐消失、食欲增加、开始出汗等；⑥ 尿量开始增多，尿的颜色与混浊度以及气味会发生改变。
第二过程、清除肾脏病变组织与免疫复合物过程（清除病灶阶段）
选择性靶向定位的微化化后的中药活性物质，在扩张肾动脉，增加供氧、改善微循环的前题下，特异性的与病变组织和免疫复合物紧密融合后，对病灶的攻击力突然暴发，将免疫复合物以及增生的系膜细胞、基质、硬化的肾小球等病变组织逐渐彻底击碎，裂解，最后分解成细小的碎片，随血循环，经吞噬细胞吞噬或代谢、排泄等。同时微化中药活性物质对侵入肾脏的免疫复合物在它们尚未致病之前就消灭它们，并适时地释放出对身体有效的微量物质，改善病人的健康状况。
该过程的临床治疗特点：
临床症状逐渐好转，化验指标稳定、病情逐渐稳定，只要不受易感因素影响，该过程的、尤其是清除功能会持久发挥下去。
第三过程、对病变组织的修复与重建过程（修复重建阶段）
修复功能分以下三步骤：
1、选择性靶向定位作用：
微化中药活性物质，对肾小球滤过膜的修复，阻止其继续增生；抑制GBM胶原细胞活性进展，修复断裂的基底膜（断裂的微化中药分子链与其有极强的亲和性）增加机械屏障的滤过面积，恢复正常通透性。
2、修复基底膜的电荷屏障功能：
微化化后断裂的中药活性物质的分子链与基底膜有极强的融合性，其断裂的分子链带有正电荷与病损细胞分子价键结合后，再次稳定下来，其效能就是促进基底膜上的硫酸类肝素和唾液酸蛋白的合成、抑制其分解，从而保持了基底膜阴电荷屏障功能，减少蛋白的继续漏出，增加毒素的排出。微化化后的中药活性物质既修复了基底膜电荷屏障，又恢复了基底膜的选择性滤过功能。
3、重组与重建机制参与肾小球的修复：
微化化后的其它断裂的分子链之间相互重组，产生一种新的功能，并与受损肾脏组织细胞中不完善的分子链相结合，组成新的分子，改变了细胞分子的价健结构，修复受损细胞的DNA，同时促使血液加速，增强了新陈代谢，关键是激活了受损细胞的DNA复制机制。促进受损肾脏组织细胞修复与再生，促使受损组织重建。受损肾脏结构改变后，受损的肾功能逐渐恢复。
该阶段的主要特点（供氧降压）、化瘀（清除）、生新（修复与重建）三个步骤关键是为了修复，结构改变后，肾功能才可逐渐恢复，临床症状才可好转。然而修复是一个较长的过程，所以坚持持久治疗是根本，修复后的肾脏组织具有极强的抗病能力，一旦修复到位，是不会再被疾病攻击，愈后不会再复发。
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