银杏经过若干年的遗传变异，形成了许多变种。根据种核的长宽比例将银杏品种划分为5大类。
1、长子类种核纺锤状卵圆形，一般无腹背之分。上端三纯．下部长楔形。两侧棱线上部明显，下部仅见痕迹。品种有金坠子、橄榄果、粗佛子、圆枣佛手、金果佛手、叶籽银杏、余厂长籽、天目长籽、九甫长籽等。
2、佛指类种核卵形，腹背面多不明显。种核下宽上窄，二秃尖。两侧棱线明显，不具翼状边缘。品种有佛指、七星果、扁佛指、野佛指、尖顶佛手、洞庭佛手、早熟大佛子、野尾银杏、长柄银杏、小黄白果、青皮果、黄皮果、贵州长白果、长糯白果等。
3、马铃类种核宽卵形或宽倒卵形，大部上宽下窄，一般三背腹之分。种核最宽处有不明显的横脊。种核先端突尖或乏尖，两侧棱线明显，中部以上尤显。品种有海洋皇、马铃、白果、圆底果、圆锥佛手、汪槎银杏、李子果等。
4、梅核类种核近卵形或短纺锤形，上下宽度基本相等。三端圆秃，具微尖，两侧棱线明显，中上部呈窄翼状，有时延至芸部。品种有梅核、棉花果、珍珠子、眼珠子、庐山银杏等。
5、圆子类种核近圆形或扁圆形，腹背面不明显。一般较马铃为小，上下左右基本相等。上端钝圆，具不明显之小尖，两侧棱线自上而下均基本明显，并呈翼状边缘。
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