病毒性肝炎，尤其是乙型肝炎在发展成肝硬化后，有的病毒仍在复制，在血液及肝组织中采用PCR检测或原位杂交时检测出病毒的RNA或DNA。所以仍有必要进行抗病毒治疗。
抗病毒治疗首先要了解患者的HBV是否处于复制状态。只有在乙肝“2对半”中的HBsAg确实阳性，或HBeAg为阴性，但HBV-DNA仍为阳性者，说明HBV在复制，可进行抗病毒治疗。近年来，国内开展了HBV-DNA的定量检测，发现目前较为常用的斑点杂交不够敏感，不少斑点杂交结果为阴性者，定量检测证明病毒仍在复制。故在斑点杂交的敏感性未提高前，对HbeAg已阴转，但肝功能仍不正常者，应该用定量方法检测，确定病毒是否复制．是否进行抗病毒治疗。目前所有的抗HBV有效药物或综合措施，只能使其复制指体阴转，也就是HBeAg和HBV-DNA阴转，对HBsAg均无明显作用。所以，经过治疗复制指标阴转即为有效。市面上有些药物宣传，所谓能使HbsAg转阴转率高达百分之几十，都是没有科学资料和依据的，当然不可信。医务人员应对患者耐心解释说明，使患者掌握这方面的常识．以免乱服药．白花钱。
目前国外、国内公认有效的药物有以下几种：
1．干扰素（IFN）
用于慢性乙型肝炎的干扰素．主要是a干扰素。a干扰素治疗慢性乙型肝炎已有20多年，基本有了共识：
（1）a干扰素治疗慢性乙型肝炎是一种有效的药物，但疗效不满意。持久有效率（指停药后随访1年；血清HBV-DNA和HbeAg的阴转率约20％～40％）。
（2）a干扰素的抗HBV作用，主要是抑制HBV复制，表现为血清HBeAg及HBV-DNA阴转，难以清除HBV，因此，治疗后复发率较高。
（3）国内的经验是各种干扰素之间疗效没有差异，国产的和进口的，a2a和a2b等疗效相仿，可根据患者的经济承受能力选用。
（4）IFN治疗有一些副作用，早期有类似流感样症状，后期可出现乏力、抑郁症、骨髓抑制以及某些自身免疫性疾病。IFN治疗费用昂贵，使用受到限制。
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